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文章列表

专栏 · 8 篇

空间组学入门

把表达放回组织里,理解位置、邻域与样本差异。

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  1. 第 1 篇 空间转录组测到了什么
  2. 第 2 篇 读入空间表达、坐标和组织图像
  3. 第 3 篇 检查空间数据质量,再决定保留哪些位置
  4. 第 4 篇 从表达聚类到组织区域
  5. 第 5 篇 寻找有空间规律的基因
  6. 第 6 篇 借助单细胞参考解释空间表达组成
  7. 第 7 篇 分析区域和细胞的邻居
  8. 第 8 篇 比较多张空间切片与实验条件
专栏 · 7 篇

单细胞组学入门

从表达矩阵开始,认识细胞及其变化。

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  1. 第 1 篇 scRNA-seq 测量的是什么
  2. 第 2 篇 从 scRNA-seq 读段到表达矩阵
  3. 第 3 篇 导入 scRNA-seq 矩阵,检查细胞质量
  4. 第 4 篇 从表达计数到归一化、降维和聚类
  5. 第 5 篇 给细胞群命名:标记基因与注释证据
  6. 第 6 篇 合并多个单细胞样本,再判断是否需要整合
  7. 第 7 篇 按生物学重复比较单细胞表达差异
专栏 · 8 篇

GWAS 入门与实操

从基因型出发,读懂关联信号背后的统计方法。

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  1. 第 1 篇 GWAS 分析流程与统计概念
  2. 第 2 篇 先认清文件,再打开终端
  3. 第 3 篇 先检查数据,再讨论显著性
  4. 第 4 篇 把群体背景和亲缘关系放进分析
  5. 第 5 篇 运行第一次关联分析
  6. 第 6 篇 读懂曼哈顿图与 QQ 图
  7. 第 7 篇 基因型定相与填补:软件流程和质量检查
  8. 第 8 篇 一片关联信号里,怎样缩小候选范围

SNP-VGAE:基因组预测与位点归因的方法记录

记录 SNP-VGAE 的两条输入路线、个体关系图、联合损失与位点归因,区分历史实验结果、验证缺口和上位性假设。
5012 字
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25 分钟

CQ_tools:全自动化的染色体商 (CQ) 分析管道

介绍 CQ_tools 项目:一个集成了比对、计算与可视化功能的染色体商 (Chromosome Quotient) 分析工具
614 字
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3 分钟

新年快乐

2026-02-17
祝大家新年快乐!万事如意!
220 字
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1 分钟

12月度过大半的杂谈

今日杂谈的一点碎碎念
1541 字
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8 分钟

我喜欢耶加雪菲

难得闲了下来,思绪又把我拉到了过去。
858 字
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4 分钟
我喜欢耶加雪菲 的封面图

我为什么学习生物信息

为什么我们需要学习生物信息,为什么生物学可以很好的与计算机信息处理结合
1706 字
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9 分钟
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